Os vagões que fazem parte das composições da Serra Verde Express pertencem a três categorias: turística, econômica e luxo. Na categoria de luxo operam vagões com projetos especiais de customização e todos assinados pela arquiteta da casa, Lucille Amaral. São vagões especiais e que não deixam de ser temáticos. São eles, o Vagão Camarote, o Vagão Imperial, o Vagão Barão do Cerro Azul, as Litorina de Luxo e recentemente o Vagão Trem Pet. A composição é formada ainda pelos Vagões Turísticos e pelos Vagões Econômicos.